Special Fields of Clinical Microbiology (3 cr)

Objectives (course unit)

Students
- know the most common viruses, mycobacteria, fungi, parasites and their properties
- know the most common infectious diseases caused by viruses, mycobacteria, fungi and parasites
- can take representative virological, mycobacteriological, mycological and parasitological samples and guide clients and other health care professionals in sample taking
- know preanalytical demands and clinical meaning of virological, mycobacteriological, mycological and parasitological analyses
- know diagnostic methods of virology, mycobacteriology, mycology and parasitology
- are able to take part in discussions concerning production of clinical microbiological laboratory services, for example point of care tests
- can implement and promote quality assurance in clinical microbiology
- are able to evaluate new methods and are interested in developing their competence

Content (course unit)

Concepts of virology, mycobacteriology, mycology and parasitology
Classification, common properties, structure, multiplication and growth demands of viruses, mycobacteria, fungi, and parasites
Viruses, mycobacteria, fungi, and parasites as pathogens and the most common infectious diseases caused by them
Antimicrobic medication, their influence and resistance mechanisms
Prevention of diseases caused by viruses, mycobacteria, fungi, and parasites, and related vaccinations
Taking, processing, storage, and transportation of virological, mycobacteriological, mycological and parasitological samples
Various identification methods of viruses, mycobacteria, fungi, and parasites
Occupational safety and aseptic working methods in virology, mycobacteriology, mycology and parasitology
Quality assurance in clinical microbiology

Prerequisites (course unit)

The student must have passed 7B00BC26 Orientation to Clinical Microbiology and 7B00BC27 Bacteriology before this course.

Location and time

Ks. toteutussuunnitelma ja Pakki

Exam schedules

Varsinainen koe 16.12.21 klo 8.30-10 (Moodle-koe)
Mahdolliset uusinnat tammikuussa ja helmikuussa 2022 sekä korotuskoe sovitusti.

Evaluation methods and criteria

Opiskelija osallistuu opetukseen (laboraatiot ja seminaarit pakollisia). Annettujen tehtävien arviointi numeerisesti (1/2 arvosanasta). Osiosta on kirjallinen koe, joka arvioidaan numeerisesti. 1. suorituskerta on varsinainen ryhmän sovittu koepäivä, mahdolliset uusinnat sovitusti

Assessment scale

0-5

Teaching methods

-luento, ryhmätyö, esitysseminaarit ja itsenäiset opiskelut (verkko-opiskelu, kirjallisuuden luku ja tehtävän teko), opintopiirit, ohjattu harjoittelu opetuslaboratoriossa

Learning materials

Moodlessa oleva materiaali
Terho Heikkinen (toim.), Asko Järvinen (toim.), Seppo Meri (toim.), Olli Vapalahti (toim.), Jaana Vuopio (toim.). Kustannus Oy Duodecim 2020. Mikrobiologia : mikrobiologia, immunologia ja infektiosairaudet, kirja 1. Mykobakteerit, Sienet ja niiden aiheuttamat taudit, Parasiitit ja niiden aiheuttamat taudit.
Soveltuvin osin:
- Hedman, K., Heikkinen. T., Huovinen. P. ym (toim). 2011. Infektiosairaudet. Kustannus oy Duodecim. Parasitologiset tutkimukset s. 65-75, Sienilääkkeet s. 205-213, Parasiittilääkkeet s. 218-227.

Student workload

3 op= 81 t työtä.
Ks. Moodle toteutussuunnitelma

Content scheduling

Opintojakson sisältö
Opintojakson sisältö
Kliinisen virologian, mykobakteriologian, mykologian ja parasitologian käsitteet
Virusten, mykobakteerien, sienten ja parasiittien luokittelu, rakenne, yleiset ominaisuudet, lisääntyminen ja kasvuvaatimukset
Virukset, mykobakteerit, sienet ja parasiitit taudinaiheuttajina ja niiden aiheuttamat keskeiset infektiotaudit
Virus-, mykobakteeri-, sieni- ja parasiittilääkkeet, niiden vaikutus- ja resistenssimekanismit
Virus-, mykobakteeri-, sieni- ja parasiittitautien ehkäisy ja rokotteet
Virus-, mykobakteeri-, sieni ja parasiittinäytteiden otto, käsittely, säilytys ja lähettäminen
Virusten, mykobakteerien, sienten ja parasiittien erilaiset tunnistamismenetelmät l. laboratoriodiagnostiikka
Työturvalliset ja aseptiset työtavat virologiassa, mykobakteriologiassa, mykologiassa ja parasitologiassa
Kliinisen mikrobiologian tutkimusten laadunhallinnan osatekijät ja kokonaisuus
Parasiitit sisältävät malariadiagnostiikan

Completion alternatives

AHOT

Practical training and working life cooperation

8 t/ opiskelija laboraatioita koulun opetuslaboratoriossa syksyllä 2021

Further information

The course includes clinical training in the university of applied sciences' teaching laboratory.