Microbiology (4cr)
Code: 7B00EG41-3001
General information
- Enrolment period
 - 24.05.2021 - 10.12.2021
 - Registration for the implementation has ended.
 
- Timing
 - 25.10.2021 - 31.03.2022
 - Implementation has ended.
 
- Credits
 - 4 cr
 
- Mode of delivery
 - Contact learning
 
- Unit
 - Biomedical Laboratory Science
 
- Campus
 - TAMK Main Campus
 
- Teaching languages
 - Finnish
 
- Degree programmes
 - Degree Programme in Biomedical Laboratory Science
 
Objectives (course unit)
The student
- is able to carry out basic examinations in bacteriological diagnostics safely, reliably and economically and can explain the basics of his/her actions
- can describe the microbiological analysis process and its progress
- can evaluate preanalytic data, sample quality and quality factors of the analysis process in their work and in reporting the results of the analyses
- is familiar with the information systems and result reporting practices used in the laboratory
- is able to operate in a multidisciplinary work community and evaluate one's own skills
- is familiar with the clinical relevance of the laboratory results
- is familiar with monitoring and reporting practices for infectious diseases
- is able to guide clients and other health care professionals in the most common microbiological tests and sampling issues
                    
Content (course unit)
Practice of bacteriological analysis process under supervision in one or two of the following bacteriological tasks (depending on the clinical training place): urine culture, pus culture (aerobic), blood culture. Additionally, if possible: drug susceptibility and resistance testing, automated workstations, culture media and/or PCR. 
Assignments for practice: 
Primary culture 
Pure and spread culture 
Identification and identification criteria for bacteria 
Most common further analysis methods and stains 
Susceptibility tests (performance, measurement, and reporting results) 
Automation in clinical microbiology 
Result-reporting practices and clinical significance of results 
Follow-up and reporting practices concerning infectious diseases 
Quality assessment methods 
Occupational safety and economy 
Work community skills
                    
Prerequisites (course unit)
Participation in the module requires that Introduction to Clinical Microbiology 7B00EG26 and Bacteriology 7B00EG27 have been completed prior to the supervised practice.
                    
Assessment criteria, satisfactory (1-2) (course unit)
-
                    
Assessment criteria, good (3-4) (course unit)
-
                    
Assessment criteria, excellent (5) (course unit)
-
                    
Assessment criteria, pass/fail (course unit)
The student
- is able to perform basic bacteriological procedures under supervision
- is able to assess the validity of the sample
- is able to give instructions for collecting microbiological samples
- can work carefully, systematically, safely, aseptically and economically
- knows different culture and staining techniques and susceptibility tests
- knows the basic use of automation in bacteriology
- can identify the most common bacteria microscopically and macroscopically
- is able to select and perform the most common further analysis methods
- understands the basics of the progress of the microbiological research process
- knows the basics of giving results to microbiological analysis and is able to assess the clinical meaning of the result
- is able to perform different stages of microbiological quality assurance and to evaluate the reliability of the results
- is familiar with the preparation of media and the molecular biological methods of clinical microbiology
- is cooperative and shows initiative and interest in professional development
- works according to agreed practices and takes responsibility for his/her actions
- can realistically evaluate his/her activities and takes advantage of the feedback received
                    
Location and time
3 viikon harjoittelu joko 25.10.2021-20.12.202 tai keväällä 2022
                    
Exam schedules
-
                    
Assessment methods and criteria
Kirjattu sanallinen  palaute työelämäohjaajilta. Suoritusmerkintä, kun työelämäpalaute/arviointikaaveke on palautettu ja harjoittelujaksoon liittyvä Teams-tehtävä on tehty.
                    
Assessment scale
Pass/Fail
                    
Teaching methods
Ohjattu työelämäharjoittelu mikrobiologian laboratoriossa
                    
Learning materials
Aiemmin opitun kertaus ennen harjoittelujaksoa
                    
Student workload
7,5 t/ harjoittelupäivä 3 viikon ajan
                    
Content scheduling
Kussakin harjoittelupaikassa laaditaan oma ohjelma
                    
Completion alternatives
AHOT
                    
Practical training and working life cooperation
Kyseessä työelämässä tapahtuva harjoittelu.
Harjoittelujaksoon liittyvä itsenäinen opiskelu ja harjoitteluraportti:
Opiskelija kertaa ennen harjoittelujakson alkua ja sen aikana aiemmin oppimaansa. Tämän tukena on Moodle-kurssi Bakteriologia ja opiskelijoiden yhteinen Teams-keskustelu mikrobiologiasta.
Harjoittelun aikana opiskelija kirjoittaa harjoitteluraporttia oppimastaan Teams-keskustelualustalle. Raportin tavoitteena on tukea ja vahvistaa omaa oppimista, kokonaiskuvaa bakteerien tunnistamisesta, tunnistamiskriteereistä, jatkotunnistusmenetelmistä, vastauskäytännöistä, vastauksen kliinisestä merkityksestä, työturvallisuudesta ja laadunhallinnasta. Tarkoitus ei ole toistaa työohjeita eikä koululla opittua vaan kertoa mitä uutta opit työprosesseista. Raportti palautetaan viimeistään viikko ko jakson päättymisen jälkeen Teams-alustalle mikrobiologian kansioon. Tarkoituksena on, että muut opiskelijat, jotka ovat menossa samaan harjoittelupaikkaan lukevat raporttia ennen jaksoaan ja kommentoivat, kyselevät ja täydentävät omassa raportissaan aiemmin esiin nostettua. Harjoittelujaksojen loputtua koululla tehdään vielä kokooma eri laboratorioiden käytäntöjen vertailemiseksi ja yhteenvedoksi ko raporttien pohjalta.
                    
International connections
-
                    
Further information
The course includes training in clinical microbiology laboratories under supervision.
                    
Assessment criteria - pass/fail (Not in use, Look at the Assessment criteria above)
Opiskelija osaa
- suorittaa bakteriologian perustyötehtäviä ohjausta saatuaan
- osaa arvioida näytteen tutkimuskelpoisuutta
- osaa antaa ohjeita mikrobiologisten näytteiden ottoon
- osaa työskennellä huolellisesti, suunnitelmallisesti, turvallisesti, aseptisesti ja taloudellisesti
- osaa yleisimmät viljely- ja värjäystekniikat sekä herkkyysmääritysten suorittamisen
- osaa bakteriologian automaation peruskäytön
- tunnistaa yleisimmät bakteerit mikroskooppisesti ja makroskooppisesti
- osaa valita ja suorittaa tavallisimmat jatkotunnistustutkimukset
- ymmärtää mikrobiologisen tutkimusprosessin etenemisen perusteet
- osaa mikrobiologisten tutkimusten vastaamisen perusteet ja osaa arvioida vastauksen kliinistä merkitystä
- osaa suorittaa mikrobiologisen laadunvarmistuksen eri työvaiheita ja osaa arvioida vastauksen luotettavuutta
- tuntee elatusaineiden valmistusta ja kliinisen mikrobiologian molekyylibiologisia menetelmiä
- on oma-aloitteinen, yhteistyökykyinen ja osoittaa kiinnostusta ammatillista kehittymistään kohtaan
- toimii sovittujen toimintatapojen mukaisesti ja ottaa vastuun toiminnastaan
- osaa realistisesti arvioida omaa toimintaansa ja hyödyntää saamaansa palautetta