Bacteriology (3 cr)

Objectives (course unit)

Students
- are able to collect representative bacteriological samples safely and reliably
- are able to supervise other people in collecting the samples
- know preanalytical demands and clinical meaning of bacteriological samples
- are able to consider and ensure validity of bacteriological samples
- know devices, equipment, and analysis methods used in bacteriology
- are able to perform reliable basic bacteriology analyses and understand fundamentals of their operation
- can maintain and promote safe working methods in bacteriology
- know microbes, infections, prevention and care of infectious diseases and are able to integrate this knowledge in evaluating and reporting of results
- know the most common antimicrobics, and their influence and resistance mechanisms
- know the reporting and registration practice of infectious diseases
- implement and promote quality assurance in clinical microbiology
- are interested in developing their competence

Content (course unit)

Research process in bacteriological laboratory, devices, equipment, and analysis methods
Collection and preanalytics of bacteriological samples
Identification methods of bacteria and their selection
Safety and quality assurance in bacteriology
Reporting and registration of infectious diseases
Clinical meaning of bacteriological findings
Antimicrobics, their influence and resistance mechanisms

Prerequisites (course unit)

The student must have passed 7B00BC26 Orientation to Clinical Microbiology before the course 7B00BC27 Bacteriology.

Location and time

Ks. Pakki

Exam schedules

Varsinainen koe 11.12.2020
1. uusinta tammikuussa Examissa
2. uusinta maaliskuussa Examissa

Evaluation methods and criteria

Opintojaksosta on kirjallinen koe (arvioidaan numeerisesti) ja harjoitustunneista raportti, joka arvioidaan hyväksytty/ hylätty

Assessment scale

0-5

Teaching methods

Verkko/ etäluennot
Itsenäinen opiskelu
Harjoitustunnit/ laboraatiot Tampereella

Learning materials

1. Hedman, K., Heikkinen, T., Huovinen, P., Järvinen, A., Meri, S., Vaara, M. (toim) 2010. Mikrobiologia. Mikrobiologia, immunologia ja infektiosairaudet, kirja 1. Duodecim. WS Bookwell Oy. Jyväskylä.
2. Aerobibakteerien tunnistaminen. Moodin erillisjulkaisu 4/ 1995. LabQuality Oy. Helsinki
3. Hedman, K., Heikkinen, T., Huovinen, P., Järvinen, A., Meri, S., Vaara, M. (toim) 2010. Infektiosairaudet. Mikrobiologia, immunologia ja infektiosairaudet, kirja 3. Duodecim. Bookwell Oy. Porvoo.
4. FiRe-standardi - Bakteerilääkeherkkyyden määrittäminen kiekkomenetelmällä. http://www.finres.fi/index.php?id=34
5. Tabula/ Moodle- oppimisympäristössä kurssi Bakteriologia

Student workload

20 t Verkko/ etäluentoja
20 t harjoitustunteja
45 t itsenäistä opiskelua

Content scheduling

Ks. toteutussuunnitelma Moodlessa

Completion alternatives

AHOT

Practical training and working life cooperation

20 t/ opiskelija laboraatioita mikorbiologian luokassa

Further information

Kl mikrobiologian perusteet ja bakteriologian opintojaksot ovat edellytyksiä kl. mikrobiologian harjoittelujaksolle

Assessment criteria - satisfactory (1-2) (Not in use, Look at the Assessment criteria above)

Tyydyttävä (1-2)  
Opiskelija
- osaa nimetä kliinisen mikrobiologian näytteiden preanalyyttiset vaatimukset, tavallisimmat näytteenotot, välineet ja perustutkimukset 
 - osaa ohjeistusta seuraten ottaa kliinisen bakteriologian perusnäytteet turvallisesti
- osaa suorittaa työohjeiden mukaisesti opintojaksolla tehtävät kliinisen mikrobiologian perustutkimukset turvallisesti
– osaa tunnistaa yleisimpiä bakteereita makroskooppisesti ja valita tarvittavat jatkotutkimukset
- osaa määritellä bakteriologian diagnostiikan menetelmien periaatteet ja menetelmävalintojen perusteita sekä tutkimusten kliinistä merkitystä
- osaa määritellä joitain ko menetelmien laadunhallinnan periaatteita ja tunnistaa työturvallisuustekijöitä
-valmistautuu harjoitustunneille / annettuihin tehtäviin
- ottaa vastuun omasta suoriutumisestaan  ja toimii ryhmässä
-osallistuu annettuihin tehtäviin ryhmässä ja tunnistaa omalle alalle tärkeitä toimintatapoja
-vastaanottaa palautetta

Assessment criteria - good (3-4) (Not in use, Look at the Assessment criteria above)

Hyvä (3-4)  

- osaa selittää kliinisen mikrobiologian näytteiden preanalyyttiset vaatimukset, tavallisimmat näytteenotot, välineet ja perustutkimukset 
-osaa ottaa luotettavasti ja turvallisesti kliinisen bakteriologian perusnäytteet ja ohjata muita näytteiden ottamiseen
-osaa suorittaa opintojaksolla tehtävät kliinisen mikrobiologian perustutkimukset turvallisesti sekä soveltaa oppimaansa tutkimusten suorittamisessa
– tunnistaa bakteereita makroskooppisesti ja osaa valita tarvittavat jatkotunnistustutkimukset sekä perustella valintansa
- tuntee bakteriologian diagnostiikan menetelmien periaatteet ja menetelmävalintojen perusteet sekä tutkimusten kliinistä merkitystä
- jäsentää menetelmien laadunhallintaa
-työskentelee huolellisesti ja luotettavasti  
-osaa soveltaa ja arvioida oppimaansa sekä arvioida suoritusta
-ottaa vastuuta ja sitoutuu oman toiminnan lisäksi myös ryhmän toimintaan  
-antaa ja vastaanottaa palautetta ja noudattaa alalle tärkeitä toimintatapoja

Assessment criteria - excellent (5) (Not in use, Look at the Assessment criteria above)

Kiitettävä (5) 

- ymmärtää ja osaa perustellen selvittää kliinisen mikrobiologian näytteiden preanalyyttiset vaatimukset, tavallisimmat näytteenotot, välineet ja perustutkimukset 
- osaa ottaa luotettavasti ja turvallisesti kliinisen bakteriologian näytteet ja ohjata muita näytteiden ottamiseen ja perustella valintojaan
-osaa luotettavasti ja turvallisesti suorittaa opintojaksolla tehtävät kliinisen mikrobiologian perustutkimukset ja soveltaa oppimaansa tutkimusten suorittamisessa
- tunnistaa makroskooppisesti kliinisesti merkittäviä bakteereita ja osaa valita tarvittavat jatkotunnistustutkimukset sekä arvioida erilaisia vaihtoehtoja
- hallitsee ja ymmärtää bakteriologian diagnostiikan menetelmien periaatteet ja menetelmävalintojen perusteet sekä tutkimusten kliinisen merkityksen
- osaa arvioida ja toteuttaa menetelmien laadunhallintaa
- työskentelee huolellisesti, suunnitelmallisesti ja luotettavasti  
- osaa etsiä erilaisia toimintatapoja ja ratkaisuvaihtoehtoja  
- kehittää omaa ammatillista osaamistaan tavoitteellisesti ja monipuolisesti  
-toimii vastuullisesti ja sitoutuneesti sekä rakentavasti ryhmän jäsenenä